Les techniques de coloration sont standardisées, automatisées et manuelles
Les principales colorations effectuées sont :
Hématéine-éosine, Acide périodique de Schiff (PAS), Bleu alcian (pH 2,5 ou neutre) ou combiné au PAS, Giemsa, Gram, Grocott, Hale, May Grunwald Giemsa, Orcéine, Orcéine modifiée (Shikata), Papanicolaou, Perls, Réticuline, Rouge Congo, Rouge Sirius, Trichrome de Masson, Von Kossa, Warthin Starry, Ziehl
